Högskolans verksamhet leds av högskolestyrelsen och rektor. Styrelsens ansvar definieras genom högskolelagen
och högskoleförordningen
. Rektor svarar för den verkställande ledningen närmast under styrelsen. Prorektor är rektors ställföreträdare. Förvaltningen leds av förvaltningschefen.
Utbildning och forskning vid Högskolan i Halmstad är organiserad i fem sektioner: Sektionen för humaniora, Sektionen för informations- data- och elektroteknik, Sektionen för hälsa och samhälle, Sektionen för lärarutbildning samt Sektionen för ekonomi och teknik. Därutöver finns Enheten för kontakter och samverkan med ansvar för övergripande samverkansfrågor. Förvaltningen och Högskolebiblioteket utgör egna enheter.
Utöver högskolestyrelsen finns tre övergripande kollegiala organ: Utbildningsnämnden, som ansvarar för och beslutar om frågor som rör grundutbildningen; Lärarutbildningsnämnden med det övergripande ansvaret för utbildning och forskning inom Sektionen för lärarutbildning; samt fakultetsnämnden som har det övergripande ansvaret för forskning och forskarutbildning samt för beredning och tillsättning av vissa lärarkategorier inom sina respektive områden.



